MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76 plasmid ABB7_B

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010941	AG	3	6	245	250	50 %	0 %	50 %	0 %	190151405
2	NC_010941	A	7	7	454	460	100 %	0 %	0 %	0 %	190151405
3	NC_010941	A	6	6	465	470	100 %	0 %	0 %	0 %	190151405
4	NC_010941	T	6	6	500	505	0 %	100 %	0 %	0 %	190151406
5	NC_010941	TAG	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190151406
6	NC_010941	GAC	2	6	572	577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190151406
7	NC_010941	TAA	2	6	640	645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190151406
8	NC_010941	GAA	2	6	674	679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190151406
9	NC_010941	ACA	2	6	778	783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190151406
10	NC_010941	AAGG	2	8	792	799	50 %	0 %	50 %	0 %	190151406
11	NC_010941	TAC	2	6	860	865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190151406
12	NC_010941	AAC	2	6	938	943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190151406
13	NC_010941	A	7	7	954	960	100 %	0 %	0 %	0 %	190151406
14	NC_010941	A	6	6	992	997	100 %	0 %	0 %	0 %	190151406
15	NC_010941	ACGG	2	8	1016	1023	25 %	0 %	50 %	25 %	190151406
16	NC_010941	CGAC	2	8	1057	1064	25 %	0 %	25 %	50 %	190151406
17	NC_010941	A	6	6	1120	1125	100 %	0 %	0 %	0 %	190151406
18	NC_010941	ATCA	2	8	1129	1136	50 %	25 %	0 %	25 %	190151406
19	NC_010941	CAG	2	6	1209	1214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190151406
20	NC_010941	AG	3	6	1232	1237	50 %	0 %	50 %	0 %	190151406
21	NC_010941	CAG	2	6	1290	1295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190151406
22	NC_010941	A	6	6	1355	1360	100 %	0 %	0 %	0 %	190151406
23	NC_010941	TAA	2	6	1446	1451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190151406
24	NC_010941	GTT	2	6	1452	1457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190151406
25	NC_010941	TCT	2	6	1492	1497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190151406
26	NC_010941	TAT	2	6	1515	1520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190151406
27	NC_010941	AG	3	6	1693	1698	50 %	0 %	50 %	0 %	190151407
28	NC_010941	TAT	2	6	1703	1708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190151407
29	NC_010941	T	6	6	1708	1713	0 %	100 %	0 %	0 %	190151407
30	NC_010941	TAC	2	6	1726	1731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190151407
31	NC_010941	T	7	7	1738	1744	0 %	100 %	0 %	0 %	190151407
32	NC_010941	TAT	2	6	1767	1772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190151407
33	NC_010941	TCA	2	6	1796	1801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190151407
34	NC_010941	CGC	2	6	1947	1952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190151407
35	NC_010941	CG	3	6	1977	1982	0 %	0 %	50 %	50 %	190151407
36	NC_010941	GTG	2	6	2075	2080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190151407
37	NC_010941	ATC	2	6	2142	2147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190151407
38	NC_010941	TCG	2	6	2156	2161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190151407
39	NC_010941	GCAG	2	8	2184	2191	25 %	0 %	50 %	25 %	190151407
40	NC_010941	CAT	2	6	2217	2222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190151407
41	NC_010941	GCG	2	6	2233	2238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190151407
42	NC_010941	CG	3	6	2247	2252	0 %	0 %	50 %	50 %	190151407
43	NC_010941	T	6	6	2317	2322	0 %	100 %	0 %	0 %	190151407
44	NC_010941	GCT	2	6	2329	2334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190151407
45	NC_010941	TCTG	2	8	2403	2410	0 %	50 %	25 %	25 %	190151407
46	NC_010941	GC	4	8	2430	2437	0 %	0 %	50 %	50 %	190151407
47	NC_010941	GCC	3	9	2491	2499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190151407
48	NC_010941	CA	3	6	2523	2528	50 %	0 %	0 %	50 %	190151407
49	NC_010941	GGC	2	6	2565	2570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190151407
50	NC_010941	GAAA	2	8	2574	2581	75 %	0 %	25 %	0 %	190151407
51	NC_010941	T	8	8	2637	2644	0 %	100 %	0 %	0 %	190151408
52	NC_010941	GTG	2	6	2709	2714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190151408
53	NC_010941	CGC	2	6	2750	2755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190151408
54	NC_010941	AGG	2	6	2835	2840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190151408
55	NC_010941	AGG	2	6	2844	2849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190151408
56	NC_010941	CGG	2	6	2886	2891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190151408
57	NC_010941	TCTG	2	8	2896	2903	0 %	50 %	25 %	25 %	190151408
58	NC_010941	GCA	2	6	2938	2943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190151408
59	NC_010941	CTT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190151408
60	NC_010941	CGC	2	6	3081	3086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190151408
61	NC_010941	GTT	2	6	3155	3160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190151408
62	NC_010941	TGG	2	6	3192	3197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190151408
63	NC_010941	GGC	2	6	3237	3242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190151408
64	NC_010941	CAG	2	6	3249	3254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190151408
65	NC_010941	GC	3	6	3325	3330	0 %	0 %	50 %	50 %	190151408
66	NC_010941	GCCTT	2	10	3381	3390	0 %	40 %	20 %	40 %	190151408

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.